冷泉港Cell新文章揭示植物避免損害分子機(jī)制
在所有的活生物體內(nèi),所有的細(xì)胞都具有相同的DNA,但每個(gè)細(xì)胞的身份則是由任何特定時(shí)間開(kāi)啟或關(guān)閉的基因組合所決定。在動(dòng)物的兩代之間這樣的細(xì)胞記憶被抹去,以致新的卵細(xì)胞沒(méi)有記憶,由此具有成為所有細(xì)胞類(lèi)型的潛能。與之相反,在開(kāi)花植物中細(xì)胞的記憶代代相傳,對(duì)于新植物的發(fā)育有可能具有潛在的有害影響。在一期的《細(xì)胞》(Cell)雜志上,來(lái)自葡萄牙古爾班基安科學(xué)研究所(IGC)和美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室(CSHL)的科學(xué)家們描述了一種有可能在花粉粒和種子中沉默移動(dòng)DNA突變序列,由此避免對(duì)新植物損害的新機(jī)制。促成細(xì)胞記憶的主要機(jī)制之一是將一種化學(xué)基團(tuán)——甲基團(tuán)添加到DNA序列上,這一過(guò)程就稱(chēng)之為甲基化作用。DNA甲基化會(huì)導(dǎo)致基因關(guān)閉。基因表達(dá)中的這些可以遺傳,但卻并不直接書(shū)寫(xiě)在DNA序列上的改變就稱(chēng)之為表觀遺傳。利用模式植物擬南芥,古爾班基安科學(xué)研究所的Jörg Becker、José Feijó和他們的研究小組,以及冷泉港實(shí)驗(yàn)室的Robert Martienssen及同事分析了花粉粒和它們前體細(xì)胞的基因組,地找到了甲基化的DNA序列?;ǚ哿0瑑蓚€(gè)精細(xì)胞(性細(xì)胞)和一個(gè)附屬的營(yíng)養(yǎng)核,營(yíng)養(yǎng)核的DNA不會(huì)傳遞給下一代。利用古爾班基安科學(xué)研究所團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)的技術(shù),研究人員分離了兩個(gè)精細(xì)胞和花粉粒的營(yíng)養(yǎng)核,分別檢測(cè)了它們的甲基化狀態(tài)。
Jörg Becker說(shuō):“我們?cè)谛约?xì)胞中揭示了一種可以防止?jié)撛谟泻D(zhuǎn)座因子激活的機(jī)制,而同時(shí)在精細(xì)胞和卵細(xì)胞融合時(shí),使得具有完力成為所有細(xì)胞類(lèi)型的細(xì)胞能夠形成,這將導(dǎo)致新的一代。另一方面,如果卵細(xì)胞中的雌性siRNAs與來(lái)自雄性的新來(lái)轉(zhuǎn)座因子不相匹配,它們有可能在發(fā)育胚胎中逃避沉默,對(duì)于生成的新植物具有潛在的有害影響。轉(zhuǎn)座因子這樣不受控制的激活至少有可能部分解釋了存在的雜交障礙,即物種間的雜交導(dǎo)致了種子發(fā)育不全或不育。打破這種障礙將提高植物培育者利用雜種優(yōu)勢(shì)現(xiàn)象改良農(nóng)作物物種的機(jī)會(huì)。”*開(kāi)花植物是重設(shè)細(xì)胞記憶規(guī)則的例外,因?yàn)樗男揎椨锌赡苓z傳數(shù)百代。然而直到現(xiàn)在對(duì)于此在植物性細(xì)胞中發(fā)生的程度,以及基因組表觀遺傳重編程有可能如何促成它還不是很清楚?,F(xiàn)在描述的機(jī)制有可能成為一個(gè)強(qiáng)有力的論據(jù)來(lái)解釋有性繁殖進(jìn)化和在大多數(shù)更高等生物體中變得如此普遍的原因。
Martienssen實(shí)驗(yàn)室的Joseph Calarco和Becker實(shí)驗(yàn)室的Filipe Borges觀察到DNA甲基化主要保持在小孢子和花粉粒中。但不同的細(xì)胞類(lèi)型之間存在著一些差異。在花粉粒中,一些DNA序列只在精細(xì)胞中而不在營(yíng)養(yǎng)核中甲基化,反之亦然。在這些非甲基化基因中移動(dòng)DNA序列,稱(chēng)作轉(zhuǎn)座因子,能夠轉(zhuǎn)為活躍狀態(tài)導(dǎo)致誘變效應(yīng)研究小組發(fā)現(xiàn)小RNA序列(siRNAs)可以挽救這種情況,恢復(fù)胚胎中轉(zhuǎn)座因子的甲基化。事實(shí)上,他們發(fā)現(xiàn)精細(xì)胞中的siRNA甚至在受精前就沉默了轉(zhuǎn)座因子,至少在某些情況下。轉(zhuǎn)座因子在所有已知基因組中非常常見(jiàn),例如它們構(gòu)成了45%的全基因組。它們參與了基因組進(jìn)化,因?yàn)楫?dāng)整合到基因組中時(shí),它們可以影響其他基因的功能和組織。不管怎樣,轉(zhuǎn)座因子是誘變劑,因?yàn)樗锌赡軐?duì)細(xì)胞和生物體有害,因此它們的激活需要在嚴(yán)格的控制下。如果這樣的有害突變發(fā)生在性細(xì)胞中,它們將傳遞至子代,擴(kuò)散到群體中。